Genome Encyclopedia of Microbes (GEM) 소개
Genome Encyclopedia of Microbes(GEM)은 다양한 미생물 유전체 정보를 통합적으로 제공하는 데이터베이스입니다.
GEM은 미생물 유전체와 관련된 다양한 데이터를 제공하며, 연구자들에게 중요한 자료를 제공합니다. 여기에는 유전체 서열, 유전자 주석, 대사 경로 정보 등이 포함됩니다.
주요 기능 및 서비스
- 통합 데이터베이스
- Escherichia coli B: 대장균 B형의 유전체 정보와 관련 데이터를 제공합니다.
- Hahella chejuensis: 제주도에서 발견된 해양 미생물 하엘라 체주엔시스의 유전체 정보를 포함합니다.
- Leuconostoc citreum: 김치 발효에 중요한 역할을 하는 유산균 류코노스톡 시트레움의 유전체 데이터베이스입니다.
- Paenibacillus polymyxa: 다양한 생물학적 응용이 가능한 파에니바실러스 폴리믹사의 유전체 정보가 제공됩니다.
- Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011: 장내 유익균인 비피도박테리움 애니말리스의 유전체 데이터입니다.
- 유전체 프로젝트
- Bifidobacterium spp.: 비피더스균 속의 여러 종에 대한 유전체 프로젝트를 진행합니다.
- Chondromyces crocatus KYC2823: 생물 막 형성에 중요한 역할을 하는 콘드로마이세스 크로카투스의 유전체 연구 프로젝트입니다.
- Donghaeana dokdonensis DSW-6: 독도 근처 해양에서 발견된 미생물 동해아나 독도넨시스의 유전체 연구 프로젝트입니다.
- Streptomyces clavuligerus: 항생제 클라불란산을 생산하는 스트렙토마이세스 클라불리게루스의 유전체 연구입니다.
- 유전체 자원
- MELDB: 유전체 대사 경로 데이터베이스입니다.
- PAIDB: 유전체 병원성도 섬 유전체 데이터베이스입니다.
- CozymeDB: 효소 관련 데이터를 제공하는 코엔자임 데이터베이스입니다.
- IPIS: 이소플라보노이드 경로 정보 시스템입니다.
- 도구 및 분석 툴
- FASIM: 유전체 서열을 빠르고 정확하게 분석할 수 있는 툴입니다.
- Peptide Mass Fingerprinting: 펩타이드 질량 지문 분석 도구입니다.
- Microarray Database for E.coli: 대장균 마이크로어레이 데이터베이스입니다.
연구 및 응용
GEM은 다양한 미생물 유전체 정보와 분석 도구를 제공함으로써 생명공학 및 의생명과학 연구에 중요한 자원을 제공합니다.
미생물 유전체 연구를 통해 유용한 유전자 및 대사 경로를 발굴하고, 이를 통해 새로운 바이오 기술 및 의약품 개발에 기여할 수 있습니다.
이 데이터베이스는 연구자들에게 다양한 미생물 유전체 데이터를 제공하며, 이를 통해 다양한 연구 및 응용이 가능합니다.
GEM은 생명공학 연구를 위한 필수적인 자원을 제공하며, 연구자들에게 많은 도움이 됩니다.
미생물 유전체에 관심 있는 연구자들은 GEM을 통해 다양한 정보를 얻고, 이를 연구에 활용할 수 있습니다.
GEM은 계속해서 데이터를 업데이트하고 있으며, 최신의 유전체 정보를 제공하고 있습니다